Investigating the Substrate Specificity of <scp>l</scp>-Rhamnose Biosynthetic Enzymes (RmlA–D): Chemoenzymatic Synthesis of an Isosteric Nonhydrolyzable TDP-β-<scp>l</scp>-Rhamnose Phosphonate
Notice bibliographique
Résumé
l -Rhamnose (Rha) is widely distributed within bacteria as a component of the polysaccharides that populate bacterial cell walls. While Rha-containing polysaccharides are highly variable in both structure and function, their presence in pathogenic bacteria has provided incentive to explore inhibition of the Rha-pathway as a means toward antibiotic development. Herein, we explore the substrate scope of the Rha biosynthetic enzymes RmlB, RmlC, and RmlD, from Aneurinibacillus thermoaerophilus, with deoxyfluoro-, aminodeoxy-, and phosphonate congeners. The isosteric phosphonate was the only congener turned over by all three enzymes demonstrating conversion to 5′-deoxythymidine- C -(1-deoxy β- l -rhamnosyl bisphosphate) (TDP-1C-Rha). Scale-up of this enzymatic process enabled the isolation of TDP-1C-Rha, an isosteric nonhydrolyzable phosphonate analogue of TDP-Rha and offers an orthogonal approach to deliver phosphonate–phosphate derived enzyme probes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».