Identification of individuals at higher risk of airway obstruction among workers in swine operations using polygenic risk scores
Notice bibliographique
Résumé
Prior studies have investigated individual single nucleotide polymorphisms (SNPs) as risk factors for the development of lung disease in swine operation workers. The aim of this study was to determine the collective effects of multiple SNPs and a polygenic risk score (PRS) in swine operation workers and identify workers at a higher risk of airway disease. This study included 374 full-time swine operation workers and 411 non-farming rural residents. Least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) with 10-fold cross-validation was used to identify SNPs, which were used to calculate a PRS score for airway obstruction. Decision tree was applied to dichotomize the PRS score into two genetic susceptible groups (high vs. low). Logistic regression was employed to examine the association between dichotomous PRS score and airway obstruction. All workers were divided into two PRS genetic susceptible groups (high vs. low) by a cutoff value of 4.196. Logistic regression showed that workers in the high PRS group were 5.5-fold more likely to be associated with airway obstruction compared to workers in the low PRS group after controlling for potential confounders. A PRS score was identified as a useful tool in identifying workers at increased risk of airway obstruction in swine operations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».