HNK-1 Antibody-Based ELISA for Soluble PTPRZ: A Practical Cerebrospinal Fluid Biomarker for Glioma
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Reliable fluid biomarkers for glioma remain elusive, complicating diagnosis and differentiation from primary central nervous system lymphoma (PCNSL). We evaluated soluble protein tyrosine phosphatase receptor type Z (sPTPRZ) in cerebrospinal fluid (CSF) using an anti-HNK-1 antibody-based ELISA. CSF sPTPRZ levels were significantly elevated in glioma patients compared with controls (AUC = 0.910) and moderately distinguished gliomas from PCNSL (AUC = 0.805). Immunohistochemistry and qPCR confirmed lack of PTPRZ expression in PCNSL, while epitope mapping localized the HNK-1 modification site to exon 12 of the long isoform. RNA-seq of the C-CAT database revealed PTPRZ-MET fusions in 2% of gliomas, all lacking the HNK-1 epitope, consistent with low CSF sPTPRZ in a subset of tumors. These findings establish CSF sPTPRZ detection with anti-HNK-1 antibody as a minimally invasive and robust biomarker for glioma, supporting improved diagnostic accuracy and aiding clinical decision-making in neuro-oncology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».