The pseudogene RPS27AP5 expresses ubiquitin and ribosomal protein variants with potential roles in ribosome function
Notice bibliographique
Résumé
Pseudogenes, traditionally considered non-functional gene copies, have garnered attention due to emerging evidence of their transcription and translation. Ubiquitin is canonically expressed from UBA52 and RPS27A genes as fusion proteins, with additional polyubiquitin precursors encoded by UBB and UBC. Several pseudogenes of these loci are annotated as non-functional. Here, we report that the RPS27A pseudogene, RPS27AP5, expresses two proteins: a ubiquitin variant (UbP5) and a ribosomal protein variant (S27aP5). These proteins mature through cleavage and exhibit localization and biochemical characteristics similar to their parental counterparts. S27aP5 integrates into ribosomes, and its overexpression leads to an increased 80S monosome fraction. Using affinity purification and polysome profiling, we show that S27aP5-containing ribosomes exhibit altered mRNA associations. The findings suggest that RPS27A, a processed pseudogene, can give rise to a ribosomal protein variant capable of integrating into monosomes and influencing mRNA association aligns with growing evidence that ribosomes may exhibit functional diversity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».