Transcriptional cofactor AtSDR4L and its paralog DIG2 repress somatic embryogenesis during post-embryonic development in Arabidopsis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Somatic embryogenesis, a developmental process advantageous as an alternative means for plant propagation due to the lack of maternal tissues and the ease of in vivo to in vitro knowledge transfer of embryogenesis, has been applied in studies on the regulatory mechanisms governing the developmental plasticity in plants. Core and accessory components of the polycomb repressive complexes (PRCs), the epigenetic regulatory machinery, are known to repress the transcription of genes that positively regulate the somatic embryogenesis in seedlings. Recent studies revealed that Arabidopsis thaliana SEED DORMANCY 4-LIKE (AtSDR4L), an interactor of a PRC accessory, represses the embryo developmental program for a successful switch from seed to seedling. However, little is known about the regulation of cell differentiation by AtSDR4L in seedlings. Here, we show that AtSDR4L, its paralog Dynamic Influencer of Gene expression 2 (DIG2), and PRC components share similar transcriptional regulatory dynamics, particularly on somatic embryogenesis-related genes. We further demonstrate that mutations in AtSDR4L and DIG2 lead to the formation of somatic embryo-like structures and a delay in cellular differentiation. Thus, transcriptional changes reflected by morphological defects associated with somatic embryogenesis in Atsdr4l dig2 mutants suggest that AtSDR4L and DIG2 prevent the dedifferentiation of cells for proper seedling growth through the transcriptional control of cell identity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».