Microbial growth and activity in static incubation: spectral induced polarization (SIP) measurements of cell suspensions in non-polarizing media
Notice bibliographique
Résumé
SUMMARY A growing body of literature has contributed to linking the presence of bacteria with SIP signals. Yet, there are still unresolved questions concerning the contribution of cell density and microbial metabolic activity in porous media (soils and sediments) to SIP signals. Moreover, there is continued debate on whether cells themselves polarize or whether a cell-sediment interaction is a prerequisite for the measured responses. This study investigates the SIP response of Shewanella oneidensis MR-1 in isolation, that is, in the absence of a mineral porous medium using two setups (i) cells in aqueous suspension and (ii) alginate bead-packed reactors. Results from experiments conducted with static cell suspensions shed light on the strong control of cell settling that drives erratic, poorly reproducible and difficult to interpret SIP signals. However, incubating cells in bead packed reactors yielded reproducible trends in σ″, with strong (3–10 mrad) signals that followed the expected cell growth behaviour. Relating σ″ to measured cell density and metabolic activity (using ATP) highlighted the strongly linked contribution of both activity and cell density and SIP. Here, we report a lower frequency polarization peak between 0.01 and 0.1 Hz in the bead reactors, which we attribute to the polarization of cell colonies in the densely packed reactors. In summary, our findings shed light on the direct contribution of cells and their activity to polarization, in the absence of cell-sediment interactions and provide a novel approach for studying cell polarization in static incubation in a porous environment.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».