Cross‐Tissue Specificity of Pediatric DNA Methylation Associated With Cumulative Family Stress
Notice bibliographique
Résumé
Cumulative family stress (cumulative FS), characterized by mother-reported co-occurring stressors in a family context, may be biologically embedded through DNA methylation (DNAm) and contribute to later health outcomes, including psychopathology. To illuminate tissue specificity in association with cumulative FS across two accessible tissues, we compared epigenome-wide DNAm associations in buccal epithelial cells (BECs; n = 218) and peripheral blood mononuclear cells (PBMCs; n = 51) from 7- to 13-year-old children in Canada, accounting for sex, age, predicted cell-type proportion, and genetic ancestry. We found that higher levels of cumulative FS were associated with DNAm at seven sites, primarily in stress- and immune-related genes, only in PBMCs but not in BECs. Matched tissue samples (n = 50) also indicated limited cross-tissue concordance. These associations were partly explained by negative but not positive mother-child relationship. Our findings suggested that PBMC DNAm can be used as a marker for biological embedding of cumulative FS and highlighted cross-tissue specificity of the associations of DNAm with cumulative FS.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».