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Enregistrement W4415948522 · doi:10.1093/ismejo/wraf248

Competitive fitness of <i>Staphylococcus aureus</i> against nasal commensals depends on biotin biosynthesis and acquisition

2025· article· en· W4415948522 sur OpenAlexaff
Kevser Bilici, David Gerlach, Laura Camus, Simon Heilbronner

Notice bibliographique

RevueThe ISME Journal · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiotin and Related Studies
Établissements canadiensInnovation Cluster (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAuxotrophyBiotinCommensalismMicrobiomePathogenStaphylococcus aureusHuman pathogen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human nasal microbiome can serve as a reservoir for pathogens. In particular, the opportunistic pathogen Staphylococcus aureus can be a member of the nasal microbiome increasing the risk of subsequent infections. The nasal carriage of S. aureus is known to be positively and negatively impacted by nonpathogenic species, suggesting interactions between the pathogen and commensals, but the underlying molecular mechanism remains largely unclear. Herein we demonstrate that S. aureus competes with nasal commensals for the coenzyme biotin. Biotin is crucial for all living organisms and we show that depletion of biotin impairs S. aureus growth and membrane integrity. We found the nasal cavity to be a biotin-limited environment, suggesting competition for the coenzyme within the microbiome. For some nasal commensals and S. aureus, we observed biotin prototrophy and all strains released biotin into the environment. In contrast, other commensals and especially coagulase-negative staphylococci (CoNS) were found to be biotin auxotrophs and strongly reliant on prototrophic strains under biotin-limited conditions. We show that high-affinity biotin uptake systems are used by prototrophic and auxotrophic strains alike and represent crucial factors to optimize competitive fitness of species in co-culture. Together, our data show that biotin-mediated interactions occur between the species of the human nasal microbiome and provide evidence for interspecies competition and co-dependency.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,322

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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