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Enregistrement W4416630637 · doi:10.1016/j.jlb.2025.100409

Plasma genotyping to identify novel resistance variants in advanced NSCLC(DISCOVER): Non-AGA report

2025· article· en· W4416630637 sur OpenAlexaff
B. Suárez, Abdulrahman Alghabban, Maryam Safi, Mary Rose Rabey, Lisa W. Le, Tong Zhang, Peter Sabatini, Shamini Selvarajah, Tracy Stockley, Natasha B. Leighl

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Liquid Biopsy · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesEuropean Commission
Mots-clésGenotypingGenotypeMutationGeneDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Results: A total of 807 LBs were performed in 791 patients (51.3% female; median age 63.5; ECOG 1 90.4%; stage IV 84.3%).Tumor types included thoracic (46%), gastrointestinal (19%), breast (10%), gynecologic (7%), and others.Overall, 67.3% of LBs were informative, with a median turnaround of 11 days.Informativeness was higher in metastatic vs non-metastatic disease (71% vs 47%, p<0.001) and in progressive vs non-progressive patients (70% vs 39%, p<0.001).ESCAT I/II alterations were found in 37%, including 30.8% of those progressing without prior molecular findings (16.4% ESCAT I).MTB recommended targeted therapy in 25.6% (50% trials, 34% standard, 16% compassionate use).CH variants were detected in 91.5% of patients, most frequently in DNMT3A (69.76%),TP53 (34.94%),CHEK2 (29.98%),ATM (25%), TET2 (16.60%), and ASXL1 (10%).After CH exclusion, 81.7% (646 patients) remained informative, with actionable findings remaining at 37%.Suspected germline variants were identified in 5.9% overall.Conclusions: PRECISO provides a comprehensive pan-tumor real-world dataset integrating LB with MTB recommendations and systematic CH filtering.LB was feasible and clinically informative, supporting therapy recommendations in onefourth of patients.Although CH was highly prevalent, it did not alter actionable ESCAT detection.To our knowledge, this is among the largest prospective pantumor series systematically applying CH filtering in an MTB setting.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,131
Score d'incertitude au seuil0,448

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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