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Enregistrement W593268778

BUTYRATE REDUCES FREE CHOLESTEROL ACCUMULATION IN NIEMANN-PICK DISEASE TYPE C1 CELLS (NOVA SCOTIA FORM) THROUGH THE INDUCTION OF ACID SPHINGOMYELINASE

2012· article· en· W593268778 sur OpenAlexaboutno aff
Chikako Oyama, Masashi Hirayama, Atsuko Noguchi, Hirokazu Arai, Tsutomu Takahashi

Notice bibliographique

RevueInstitutional Repositories DataBase (IRDB) · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNPC1Acid sphingomyelinaseButyrateButyric acidNiemann–Pick disease, type CSphingomyelin phosphodiesteraseIntracellularSphingomyelinChemistrySandhoff diseaseLymphoblastBiochemistryCholesterolBiologyEnzymeCell culture
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Niemann-Pick disease type C (NPC) is an inherited disorder caused by mutations in either the NPC1 or the NPC2 gene that affect intracellular free cholesterol trafficking. Most cases of NPC have mutations in the NPC1 gene. Acid sphingomyelinase (ASM) is a lysosomal enzyme in which an inherited deficiency leads to Niemann-Pick disease types A and B (NPDA/NPDB). Despite having a normal ASM gene, NPC cells have a secondary defect in ASM activity ; the mechanism remains to be fully elucidated. Butyrate, one of the short chain fatty acids, is known as an inducer of ASM. We investigated the effects of butyrate on ASM activity and mRNA expression in normal and NPC1 mutant (Nova Scotia form ; NPC1^<Nova Scotia>) lymphoblasts. After incubation with 10 mM butyric acid for 24 h, ASM activity was significantly increased by 3.3- and 4.6-fold in normal and NPC1^<Nova Scotia> cells, respectively (p<0.01). The secondary defect of ASM activity in NPC1^<Nova Scotia> cells was restored to normal levels by treatment of 10 mM butyric acid. In quantitative RT-PCR analysis, butyric acid significantly increased ASM mRNA levels in both types of cells (p<0.01). In addition, we investigated the effects of butyrate on intracellular free cholesterol levels in NPC1^<Nova Scotia> lymphoblasts. Free cholesterol levels in cells treated with or without 10 mM butyric acid were 0.019±0.002 and 0.026±0.006 μg/μg protein, respectively, demonstrating that butyric acid significantly decreased free cholesterol levels in NPC1^<Nova Scotia> cells (p<0.05). To determine whether ASM induced by butyric acid is directly associated with the reduction of free cholesterol accumulation in NPC1^<Nova Scotia> cells, NPDB and NPC1^<Nova Scotia> fibroblasts were treated with 10 mM butyric acid and stained with filipin. We found that butyric acid dramatically reduced the accumulation of intracellular free cholesterol in NPC1^<Nova Scotia> cells, but it did not affect NPDB cells. These data suggest that ASM induced by butyrate is related to intracellular cholesterol trafficking and metabolism in NPC1^<Nova Scotia> cells. ASM inducers, such as butyrate, may reduce the accumulation of intracellular free cholesterol in NPC1^<Nova Scotia> cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,073
Score d'incertitude au seuil0,786

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,002
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,072
Tête enseignante GPT0,350
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
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Résumé présentoui

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