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Enregistrement W613697576 · doi:10.1021/acs.jmedchem.5b00216

Development of Novel CXC Chemokine Receptor 7 (CXCR7) Ligands: Selectivity Switch from CXCR4 Antagonists with a Cyclic Pentapeptide Scaffold

2015· article· en· W613697576 sur OpenAlexafffund
Shinya Oishi, Tomoko Kuroyanagi, Tatsuhiko Kubo, Nicolas Montpas, Yasushi Yoshikawa, Ryosuke Misu, Yuka Kobayashi, Hiroaki Ohno, Nikolaus Heveker, Toshio Furuya, Nobutaka Fujii

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChemokine receptors and signaling
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceCanadian Institutes of Health ResearchMinistry of Education, Culture, Sports, Science and Technology
Mots-clésChemistryCXC chemokine receptorsCCL21Pentapeptide repeatChemokine receptorCXCR3AgonistReceptorFunctional selectivityCXCL14C-C chemokine receptor type 6CCL7PharmacologyBiochemistryChemokinePeptideBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The CXC chemokine receptor 7 (CXCR7)/ACKR3 is a chemokine receptor that recognizes stromal cell-derived factor 1 (SDF-1)/CXCL12 and interferon-inducible T-cell α chemoattractant (I-TAC)/CXCL11. Here, we report the development of novel CXCR7-selective ligands with a cyclic pentapeptide scaffold through an SAR study of CXC chemokine receptor 4 (CXCR4) selective antagonist FC131 [cyclo(-d-Tyr-l-Arg-l-Arg-l-Nal-Gly-), Nal = 3-(2-naphthyl)alanine]. Substitution of Gly with l-Pro switched the receptor preference of the peptides from CXCR4 to CXCR7. The SAR study led to the identification of a potent CXCR7 ligand, FC313 [cyclo(-d-Tyr-l-Arg-l-MeArg-l-Nal-l-Pro-)], which recruits β-arrestin to CXCR7. Investigations via receptor mutagenesis and molecular modeling experiments suggest a possible binding mode of the cyclic pentapeptide CXCR7 agonist.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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