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Enregistrement W6995803029

Phenome-wide, Metabolomic and Proteomic Association Scan of SHROOM3 Haplotypes Based on Imputed Exonic Variants

2023· article· en· W6995803029 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueView · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhosphodiesterase function and regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteSchool of Medicine, Indiana UniversityUniversity of North Carolina at Chapel HillUniversity of Texas MD Anderson Cancer CenterUniversity of WashingtonCollege of Engineering, Michigan State UniversitySchool of Medicine, University of North Carolina at Chapel HillState Key Laboratory of Oncology in South ChinaShenzhen Research Institute, City University of Hong KongMichigan State UniversityNational Taiwan UniversityNational Taiwan University HospitalChinese University of Hong KongSun Yat-sen UniversityCurtin University of TechnologyPerelman School of Medicine, University of PennsylvaniaVanderbilt University Medical CenterSun Yat-sen University Cancer CenterSchool of Medicine, Case Western Reserve UniversityCommonwealth of KentuckyRush UniversityWayne State UniversityHarvard T.H. Chan School of Public HealthPennsylvania State UniversityLeonard M. Miller School of MedicineUniversity of TorontoCase Western Reserve UniversityInstitute for Translational Medicine and TherapeuticsVanderbilt UniversityUniversity of PennsylvaniaCarolina Population Center, University of North Carolina at Chapel HillUniversity of Miami
Mots-clésHaplotypeGenetic variantsGenetic associationGenome-wide association studyGeneKidney diseaseSingle-nucleotide polymorphismAssociation (psychology)MetabolomicsProteomics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SHROOM3 encodes an actin-binding protein involved in cell shaping. Genome-wide association studies (GWAS) identified common variants at SHROOM3 associated with chronic kidney disease, creatinine-based estimated glomerular filtration rate (eGFRcrea), and serum magnesium (Mg). To understand underlying physiological mechanisms of SHROOM3, we conducted a phenome-wide, metabolomic, and proteomic analysis of SHROOM3 haplotypes in the Cooperative Health Research in South Tyrol (CHRIS) study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,721
Score d'incertitude au seuil0,299

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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Résumé présentoui

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