The search for inhibitors of O-acetylpeptidoglycan esterase 1a (Ape1a) in Neisseria gonorrhoeae
Notice bibliographique
Résumé
This thesis reports an investigation and discovery of an inhibitor of O-acetylpeptidoglycan esterase 1a (Ape1a). With the rise in rates of antibiotic resistant microbes it is becoming increasingly important to discover new targets related to the cell wall, cell membrane, or synthesis of nucleic acids and proteins. Ape1a, an esterase responsible for cleaving the acetyl group from MurNAc and allowing the activity of muramidases, presented as a potential target. Optimal storage conditions of the enzyme were determined and an assay that was amenable to high throughput screening (HTS) was developed. Ape1a was then screened against a selection from the Canadian Compound Collection in an effort to discover an inhibitor. Several compounds were determined to be false positives; however one compound, purpurin, showed true inhibition. MICs performed 'in vivo' on various Gram positive and Gram negative organisms corroborated the microtitre plate findings. These findings were further supported by results from testing performed on PO, Ape1a's natural substrate. Purpurin was found to be an effective inhibitor of 'B. cereus', an O-acetylated organism, at a relatively low concentration of 16 [mu]g/ml. These results supported the hypothesis that Ape1a is necessary for cell viability in organisms possessing Ape1a Thus, this compound serves as a potential target for drug development and may aid in the fight against drug resistant microbes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».