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Enregistrement W7117111892 · doi:10.1134/s0003683825600034

Response Mechanism of Lactobacillus plantarum under Simulated Digestion Based on Proteomics and Metabolomics Analysis

2025· article· en· W7117111892 sur OpenAlexaff
Leyi Zhao, Ziqing Cheng, Yuxi Ling, Y. Wu, M. Zhang, H. Yang, Zuming Li

Notice bibliographique

RevueApplied Biochemistry and Microbiology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensUniversity of ManitobaSinai Health System
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLactobacillus plantarumMetabolomicsProteomicsProbioticDigestion (alchemy)MetabolismBacteriaLactobacillusMechanism (biology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Proteomics and a metabolomics strategy were used to investigate the probiotic properties of Lactobacillus plantarum BW2013 under simulated in vitro digestion. Thirty seven significant differential proteins including 6-phosphogluconate dehydrogenase, pyruvate kinase, F0F1 ATP synthase, ABC-type transporters, ribosomal and universal stress proteins and 40 significant differential metabolites, such as indole-3-lactic acid, Pro, trans-cinnamic acid, betaine, citric acid, D-fructose, and γ-aminobutyric acid were identified and characterized. The association analysis indicated that most upregulated proteins and metabolites are involved primarily in stress response, regulation of intestinal flora and accumulation of beneficial substances relating to carbohydrate and energy metabolic pathways, amino acid metabolism pathways, nucleotide metabolism pathways, overall/universal stress response. The results provide new insights into the response mechanism of L. plantarum BW2013 under the simulated digestion conditions, facilitating the exploitation of its potential application in probiotic products.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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