MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W7161937561 · doi:10.82308/15665

Nonsense suppressor therapy of cystinosis

2018· dissertation· en· W7161937561 sur OpenAlexaboutno aff
Emma Brasell

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBiomedical Research and Pathophysiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCystineMutationCystinosisNonsense mutationRenal tubule

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

La cystinose est un défaut héréditaire rare et récessif causé par des mutations dans le gène de la cystinosine (CTNS). Le produit de ce gène est un transporteur de protons transmembranaire qui est responsable de l'efflux de la cystine du lysosome. Les mutations résultent en l'accumulation de la cystine dans les lysosomes de tous les tissues, ce qui induit la formation de cristaux de cystine et éventuellement la mort cellulaire. Le rein en est particulièrement affecté. Le dysfonctionnement du tubule proximal est évident à l'âge de 6 mois et le dysfonctionnement progressif des cellules glomérulaires mène à une insuffisance rénale terminale à l'âge de 10 ans. Le traitement actuel est la cysteamine, une drogue qui permet la déplétion chimique de la cystine intra-lysosomale et permet de ralentir la détérioration de l'organe. Cependant, elle ne prévient pas l'insuffisance rénale terminale ou la myopathie progressive, ce qui cause la mort du patient à environ 30 ans. Les limites cliniques de cette thérapie suggèrent que la protéine CTNS possède d'autres fonctions mis à part son rôle comme transporteur de cystine. En effet, des études récentes indiquent que CTNS joue un rôle dans les processus d'endocytose et l'autophagie. Conséquemment, un traitement efficace devrait maintenir toutes les fonctions de CTNS dans la cellule. En outre, en raison d'un effet fondateur, une grande majorité des patients atteints de cystinose au Québec possèdent une mutation non-sens (W138X). Notre hypothèse est qu'il serait possible de rétablir toutes les fonctions de la protéine CTNS dans ces patients en utilisant la capacité des aminoglycosides de transcender les codons de terminaison prématurés (CTPs). Ces antibiotiques se lient au ribosome et induisent un appariement non canonique lors de la traduction, permettant ainsi sa continuité. Le développement récent d'un aminoglycoside non-toxique (ELX-02) offre des possibilités d'applications cliniques. En utilisant les fibroblastes CTNSW138X/W138X d'un patient, nous avons démontré que ELX-02 peut rectifier les niveaux d'ARN messager de CTNS et réduire l'accumulation pathologique de cystine par 73%. Ceci est comparable à l'effet de la dose maximale de cysteamine utilisée par les patients. Par surcroît, ELX-02 a un effet similaire sur un hétérozygote CTNSW138XX/57kbDel dont une allèle est propice à la suppression des mutations non-sens. Nous avons aussi démontré, en utilisant notre modèle de souris CtnsY226X/Y226X, que ELX-02 est concentré et retenu dans le rein pour plus de 24 heures après une dose relativement faible de 10 mg/kg. A cette dose, ELX-02 réduit l'accumulation pathologique de cystine dans le rein à environ 52% des niveaux non-traités. Nos résultats suggèrent que ELX-02 corrige partiellement l'effet de la mutation franco-canadienne W138X, ce qui permet une diminution de l'accumulation pathologique de cystine. La rétention et la concentration de ELX-02 dans le rein suggèrent que cette drogue serait utile pour traiter d'autres maladies héréditaires du rein, particulièrement celles avec un grand pourcentage de mutations non-sens, telle que la polykystose rénale.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,370
Écart entre enseignants0,333 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même sujetBiomedical Research and PathophysiologyTravaux en français237 207