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Record W7161937561 · doi:10.82308/15665

Nonsense suppressor therapy of cystinosis

2018· dissertation· en· W7161937561 on OpenAlexaboutno aff
Emma Brasell

Bibliographic record

Venuenot available
Typedissertation
Languageen
FieldMedicine
TopicBiomedical Research and Pathophysiology
Canadian institutionsnot available
Fundersnot available
KeywordsCystineMutationCystinosisNonsense mutationRenal tubule

Abstract

fetched live from OpenAlex

La cystinose est un défaut héréditaire rare et récessif causé par des mutations dans le gène de la cystinosine (CTNS). Le produit de ce gène est un transporteur de protons transmembranaire qui est responsable de l'efflux de la cystine du lysosome. Les mutations résultent en l'accumulation de la cystine dans les lysosomes de tous les tissues, ce qui induit la formation de cristaux de cystine et éventuellement la mort cellulaire. Le rein en est particulièrement affecté. Le dysfonctionnement du tubule proximal est évident à l'âge de 6 mois et le dysfonctionnement progressif des cellules glomérulaires mène à une insuffisance rénale terminale à l'âge de 10 ans. Le traitement actuel est la cysteamine, une drogue qui permet la déplétion chimique de la cystine intra-lysosomale et permet de ralentir la détérioration de l'organe. Cependant, elle ne prévient pas l'insuffisance rénale terminale ou la myopathie progressive, ce qui cause la mort du patient à environ 30 ans. Les limites cliniques de cette thérapie suggèrent que la protéine CTNS possède d'autres fonctions mis à part son rôle comme transporteur de cystine. En effet, des études récentes indiquent que CTNS joue un rôle dans les processus d'endocytose et l'autophagie. Conséquemment, un traitement efficace devrait maintenir toutes les fonctions de CTNS dans la cellule. En outre, en raison d'un effet fondateur, une grande majorité des patients atteints de cystinose au Québec possèdent une mutation non-sens (W138X). Notre hypothèse est qu'il serait possible de rétablir toutes les fonctions de la protéine CTNS dans ces patients en utilisant la capacité des aminoglycosides de transcender les codons de terminaison prématurés (CTPs). Ces antibiotiques se lient au ribosome et induisent un appariement non canonique lors de la traduction, permettant ainsi sa continuité. Le développement récent d'un aminoglycoside non-toxique (ELX-02) offre des possibilités d'applications cliniques. En utilisant les fibroblastes CTNSW138X/W138X d'un patient, nous avons démontré que ELX-02 peut rectifier les niveaux d'ARN messager de CTNS et réduire l'accumulation pathologique de cystine par 73%. Ceci est comparable à l'effet de la dose maximale de cysteamine utilisée par les patients. Par surcroît, ELX-02 a un effet similaire sur un hétérozygote CTNSW138XX/57kbDel dont une allèle est propice à la suppression des mutations non-sens. Nous avons aussi démontré, en utilisant notre modèle de souris CtnsY226X/Y226X, que ELX-02 est concentré et retenu dans le rein pour plus de 24 heures après une dose relativement faible de 10 mg/kg. A cette dose, ELX-02 réduit l'accumulation pathologique de cystine dans le rein à environ 52% des niveaux non-traités. Nos résultats suggèrent que ELX-02 corrige partiellement l'effet de la mutation franco-canadienne W138X, ce qui permet une diminution de l'accumulation pathologique de cystine. La rétention et la concentration de ELX-02 dans le rein suggèrent que cette drogue serait utile pour traiter d'autres maladies héréditaires du rein, particulièrement celles avec un grand pourcentage de mutations non-sens, telle que la polykystose rénale.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.004
Threshold uncertainty score0.012

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0010.000
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0000.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0010.001
Insufficient payload (model declined to judge)0.0040.001

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.037
GPT teacher head0.370
Teacher spread0.333 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2018
Admission routes1
Has abstractyes

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