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Record W2001558957 · doi:10.1055/s-2008-1078874

CpG Motive in Plasmid DNA führen zur Verschlechterung der Lungenmechanik in Mäusen nach Aerosol Applikation eines nicht-viralen Genvektors

2008· article· de· W2001558957 on OpenAlexaboutno aff
AW Flemmer, Petra Dames, E. A. Lesina, Kerstin Hajek, Christian Rudolph

Bibliographic record

VenueZeitschrift für Geburtshilfe und Neonatologie · 2008
Typearticle
Languagede
FieldImmunology and Microbiology
TopicImmune responses and vaccinations
Canadian institutionsnot available
Fundersnot available
KeywordsPlasmidMolecular biologyChemistryCpG siteDNABiologyGeneDNA methylation

Abstract

fetched live from OpenAlex

Hintergrund: Vorangegangene Untersuchungen weisen darauf hin, dass unmethylierte CpG-Motive in einer Plasmid-DNA eine zentrale Rolle bei der Entwicklung einer inflammatorischen Antwort nach intranasaler Applikation von nicht-viralen Gen-Vektoren spielen. Ein einzelnes CpG-Motiv kann bereits zu einem Anstieg von Cytokinen nach Gen-Vektor Applikation führen. Ob diese inflammatorische Antwort einen Effekt auf die mechanischen Eigenschaften der Lunge haben, ist bisher jedoch nicht untersucht. Fragestellung: Wir untersuchten den Effekt von unmethylierten CpG-Motiven auf die mechanischen Eigenschaften der Lunge nach Aerosol-Applikation eines nicht-viralen Plasmid Vektors. Methoden: Die applizierten Gen-Vektoren wurden mit dem kationischen Polymer Polyethylenime (25 kDa) und entweder mit dem CpG-reichen Plasmid pCMVLuc oder dem non-CpG Plasmid Backbone pCpG und pCpGLuc konstruiert, die bei einer N/P Ratio von 10 für das Luciferase Reporter-Gen kodieren. Die verschiedenen Vektoren wurden Mäusen in einer Inhalationsbox appliziert. Die dynamische Lungenmechanik (Compliance, Crs und Resistance, Rrs) wurden mittels Kleintierrespirator (SAV-Flexivent, SCIREQ Inc, Montreal, Canada) nach 1 Stunde, 24 Stunden, 3 Tagen, und 7 Tagen nach Aerosolapplikation bestimmt. Ergebnisse: Während die Applikation von CpG-reichem Plasmid pCMVLuc zu einem signifikanten Anstieg von Rrs 24 Stunden und einer Reduktion von Crs 3 und 7 Tage nach der Behandlung im Vergleich zu unbehandelten Kontrollen führte, zeigte sich nach Applikation von CpG-freiem Plasmid keine Veränderung der Lungenmechanik. Wir beobachteten lediglich einen kurzen, passagären Anstieg der Resistance, eine Stunde nach Plasmid-Applikation. Schlussfolgerung: Unsere Daten zeigen, dass die Depletion von CpG-Motiven aus einer Plasmid DNA notwendig ist, um einen inflammatorischen Reaktion mit nachfolgender Verschlechterung der Lungenmechanik zu vermeiden. Diese Ergebnisse spielen eine wichtige Rolle für das Design zukünftiger Gen-Therapeutika für die Behandlung genetisch bedingter pulmonaler Erkrankungen.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.002
Threshold uncertainty score0.005

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0000.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0000.001
Insufficient payload (model declined to judge)0.0020.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.023
GPT teacher head0.283
Teacher spread0.260 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2008
Admission routes1
Has abstractyes

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