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Record W3093575074 · doi:10.5281/zenodo.6835758

Marine organisms: a source of biomedically relevant metallo M1, M2 and M17 exopeptidase inhibitors

2021· preprint· es· W3093575074 on OpenAlexaff
Isel Pascual Alonso, Laura Rivera Méndez, Fabiola Almeida García, Mario E. Valdés‐Tresanco, Yarini Arrebola Sánchez, Aida Hernández-Zanuy, Luis Álvarez-Lajonchère, Dagmara Díaz, Belinda Sánchez Pérez, Isabelle Florent, Marjorie Schmitt, Miguel Cisneros, Jean Louis Charli

Bibliographic record

VenueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2021
Typepreprint
Languagees
FieldMedicine
TopicPeptidase Inhibition and Analysis
Canadian institutionsUniversity of Calgary
Fundersnot available
KeywordsExopeptidaseProteasesBiologyProteolysisAminopeptidaseDeubiquitinating enzymeEnzymeUbiquitinBiochemistryAmino acidGene

Abstract

fetched live from OpenAlex

Las enzimas proteolíticas, conocidas como peptidasas o proteasas, son críticas en todos los organismos vivos. Pueden actuar como exo– o endopeptidasas. Las peptidasas se segregan en clases que dependen en gran medida de la natu-raleza química de los grupos involucrados en la catálisis. Controlan la activación, síntesis y recambio de proteínas, y regulan la mayoría de los procesos bioquímicos y fisiológicos. En consecuencia, son los principales reguladores de la homeostasis, el envejecimiento, las enfermedades y la muerte. Las proteasas también son esenciales para la propa-gación de agentes infecciosos, ya que son los principales contribuyentes de la patogénesis en varias enfermedades infecciosas, incluida la actual pandemia de COVID-19. Las exopeptidasas son enzimas que catalizan la escisión de los aminoácidos N-terminal o C-terminal de las proteínas o sustratos peptídicos. Están ampliamente distribuidos en mu-chos filos y desempeñan papeles críticos en fisiología y fisiopatología. Son principalmente metalopeptidasas pertene-cientes a las familias M1, M2 y M17, entre otras. Algunas de ellas, las aminopeptidasas M1 N, A y la ectoenzima que degrada la hormona liberadora de tirotropina, la enzima convertidora de angiotensina M2 y la leucil aminopeptidasa M17 son blancos actuales para el desarrollo de nuevos agentes terapéuticos para diferentes enfermedades huma-nas, que incluyen el cáncer, la hipertensión, trastornos del sistema nervioso central, inflamación, desordenes del sis-tema inmune y enfermedades infecciosas como la malaria. La relevancia de las exopeptidasas ha impulsado la bús-queda e identificación de inhibidores potentes y selectivos, como una herramienta importante para controlar la pro-teólisis con impacto en la bioquímica, la biotecnología y la biomedicina. Por estas razones, los inhibidores específicos de estas peptidasas son foco de estudio para el desarrollo de herramientas terapéuticas prometedoras en el trata-miento de diferentes trastornos. En particular, el presente trabajo centra su atención en la biodiversidad marina co-mo una fuente importante y promisoria de inhibidores de serino y metalo exopeptidasas de diferentes familias, con aplicaciones biomédicas en enfermedades humanas.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.002
Threshold uncertainty score0.008

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0010.000
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0010.000
Open science0.0000.001
Research integrity0.0010.001
Insufficient payload (model declined to judge)0.0020.001

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.022
GPT teacher head0.248
Teacher spread0.226 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations2
Published2021
Admission routes1
Has abstractyes

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