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Enregistrement W2485350468 · doi:10.1007/978-1-61779-915-0_8

Immobilization of Fluorescent Aptamer Biosensors on Magnetic Microparticles and Its Potential Application for Ocean Sensing

2012· book-chapter· en· W2485350468 sur OpenAlexaff
Po‐Jung Jimmy Huang, Imran Khimji, Juewen Liu

Notice bibliographique

RevueSpringer protocols handbooks/Springer protocols · 2012
Typebook-chapter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAptamerBiosensorAnalyteFluorescenceNucleic acidIonic strengthNanotechnologyChemistrySalt (chemistry)Combinatorial chemistryChromatographyBiochemistryMaterials scienceBiologyMolecular biologyAqueous solutionOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many important analytes are present in the ocean water and primary examples include various marine toxins. The unique marine environment possesses an extremely high ionic strength, posing a significant analytical challenge for biosensor design. Protein-based enzymes and antibodies are likely to denature under such non-physiological conditions. Aptamers are nucleic acid-based binding molecules that can be obtained using a combinatorial in vitro selection technique. Since such selections are carried out in the absence of living cells, it is possible to obtain aptamers that work optimally under high salt conditions. Similarly selections in low pH and high temperatures have already been carried out. The high salt concentration in marine samples may also cause significant fluorescence quenching, reducing the sensitivity of fluorescent aptamer sensors. We propose that this problem may be solved by immobilization of aptamer-based biosensors on magnetic microparticles, allowing spatial separation of the target binding and the fluorescence detection steps. In this chapter, we describe a protocol for the detection of adenosine and ATP in high salt buffers and in human blood serum. Compared to the non-immobilized sensor, more consistent results with reduced interference were achieved after immobilization. Future research directions of using such immobilized sensors for marine detection are also discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,383
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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